硫化亜鉛ZnS（閃亜鉛鉱型）のイオン結晶では、亜鉛原子の上下段の位置に決まりはあるの？

亜鉛原子の上下段の描き方に決まりはない

硫化亜鉛の結晶構造では図のように亜鉛原子が入れ違い（上から見ると亜鉛原子が交差している）する形となっています。亜鉛原子の上段と下段の書き方に順序は関係ありません。一段ずらした部分を切り取れば、上下段が交換されたものとなります。

図はあくまである部分を切り取ったものなんだね。